blog.fcuzhhorod.com

‘Bahkan jika seseorang terinfeksi beberapa varian, jika mereka bereplikasi di bagian tubuh yang berbeda, mereka tidak akan bereaksi satu sama lain’

seperti yang diterbitkan olehpercakapan

Ilmuwan di Brasil baru-baru ini dilaporkan bahwa dua orang secara bersamaan terinfeksi dua varian SARS-CoV-2 yang berbeda, virus penyebab COVID-19. Koinfeksi ini tampaknya tidak berpengaruh pada tingkat keparahan penyakit pasien, dan keduanya pulih tanpa perlu rawat inap.

Meskipun ini adalah salah satu dari sedikit kasus SARS-CoV-2 yang tercatat – dan penelitian ini belum dipublikasikan dalam jurnal ilmiah – para ilmuwan mengalami infeksi SARS-CoV-2. beberapa strain dengan virus pernapasan lainnya, seperti influenza. Hal ini menimbulkan pertanyaan tentang bagaimana virus-virus ini dapat berinteraksi pada orang yang terinfeksi, dan apa pengaruhnya terhadap munculnya varian baru.

Virus adalah ahli evolusi, terus bermutasi dan menciptakan varian baru di setiap siklus replikasi. Tekanan selektif pada inang, seperti respon imun kita, juga mendorong adaptasi ini. Sebagian besar mutasi ini tidak akan memberikan dampak signifikan terhadap virus. Namun hal-hal yang memberikan keuntungan bagi virus – misalnya, dengan meningkatkan kemampuannya untuk mereplikasi atau menghindari sistem kekebalan – patut dikhawatirkan dan harus diawasi secara ketat.

Terjadinya mutasi ini disebabkan oleh mesin replikasi virus yang rawan kesalahan. Virus RNA, seperti influenza dan hepatitis C, menghasilkan kesalahan dalam jumlah yang relatif besar setiap kali mereka bereplikasi. Ini menciptakan “spesies kuasi” dari populasi virus, seperti segerombolan virus, yang masing-masing memiliki rangkaian terkait namun tidak identik. Interaksi dengan sel inang dan sistem kekebalan menentukan frekuensi relatif dari masing-masing varian, dan varian yang hidup berdampingan ini dapat memengaruhi perkembangan penyakit atau seberapa baik pengobatan bekerja.

Dibandingkan dengan virus RNA lainnya, virus corona memiliki tingkat mutasi yang lebih rendah. Pasalnya, mereka dilengkapi dengan mekanisme proofreading yang dapat memperbaiki beberapa kesalahan yang terjadi saat replikasi. Namun ada buktinya virus genetik keberagaman pada pasien yang terinfeksi SARS-CoV-2.

Deteksi beberapa varian pada seseorang mungkin disebabkan oleh koinfeksi oleh varian yang berbeda, atau akibat mutasi pada pasien setelah infeksi awal. Salah satu cara untuk membedakan kedua skenario tersebut adalah dengan membandingkan urutan varian yang beredar di populasi dengan yang ada di pasien. Dalam Studi di Brasil disebutkan di atas, varian-varian yang teridentifikasi berhubungan dengan garis keturunan berbeda yang sebelumnya terdeteksi dalam populasi, sehingga menyiratkan adanya koinfeksi oleh kedua varian tersebut.

Campur semuanya

Koinfeksi ini telah menimbulkan kekhawatiran bahwa SARS-CoV-2 akan mengalami mutasi baru dengan lebih cepat. Pasalnya, virus corona juga dapat mengalami perubahan besar pada urutan genetiknya melalui proses yang disebut rekombinasi. Ketika dua virus menginfeksi sel yang sama, mereka dapat bertukar sebagian besar genomnya satu sama lain, sehingga menciptakan rangkaian yang benar-benar baru.

Itu adalah hal yang familier fenomena pada virus RNA. Varian baru influenza dihasilkan melalui mekanisme serupa yang disebut “reassortment”. Genom virus influenza, tidak seperti virus corona, terdiri dari delapan segmen atau untaian RNA. Ketika dua virus menginfeksi sel yang sama, segmen-segmen ini bercampur dan cocok untuk menghasilkan virus dengan kombinasi gen baru. Menariknya, babi dapat terinfeksi berbagai jenis virus influenza, dan disebut sebagai “bejana pencampur” yang memindahkan mereka ke suku-suku baru. Virus pandemi H1N1 2009 muncul dari reassortment virus influenza manusia, virus flu burung, dan dua virus flu babi.

Pada virus corona yang hanya mengandung satu untai RNA di setiap partikel virus, rekombinasi hanya dapat terjadi antara untai RNA yang berasal dari satu atau lebih virus dalam sel yang sama. Bukti rekombinasi ditemukan di keduanya laboratorium Dan pada seorang pasien terinfeksi SARS-CoV-2, menunjukkan bahwa hal ini dapat mendorong munculnya varian baru. Faktanya, kemampuan SARS-CoV-2 menginfeksi sel manusia adalah disarankan berevolusi melalui rekombinasi protein lonjakan antara virus corona hewan yang berkerabat dekat.

Penting untuk dicatat bahwa ini memerlukan dua virus tersebut sama sel. Sekalipun seseorang terinfeksi beberapa varian, mereka tidak akan berinteraksi satu sama lain jika mereka bereplikasi di bagian tubuh yang berbeda. Memang, itu terlihat pada pasien yang menemukan kuasispesies virus corona yang berbeda di saluran pernapasan atas dan bawah, hal ini menunjukkan bahwa virus di lokasi tersebut tidak bercampur secara langsung satu sama lain.

Bukti sejauh ini tidak menunjukkan bahwa infeksi lebih dari satu varian menyebabkan penyakit yang lebih parah. Meskipun mungkin terjadi, sangat sedikit kasus koinfeksi yang dilaporkan. Lebih dari 90% infeksi di Inggris saat ini disebabkan oleh B117 – yang disebut varian Kent. Dengan tingginya prevalensi satu varian dalam populasi, kecil kemungkinan terjadinya koinfeksi. Namun, pemantauan lanskap ini memungkinkan para ilmuwan melacak kemunculan varian baru yang menjadi perhatian ini dan memahami serta merespons setiap perubahan dalam penularan atau kemanjuran vaksin. – Percakapan|Rappler.com

Maitreyi Shivkumar adalah Dosen Senior Biologi Molekuler, Universitas De Montfort.

Bagian ini adalah awalnya diterbitkan di The Conversation di bawah lisensi Creative Commons.