blog.fcuzhhorod.com

Pada dasarnya semua strain adalah varian, namun tidak semua varian adalah strain

Hidup di tengah pandemi global selama setahun terakhir telah membuat kita semua memperluas kosa kata kita. Kami sekarang memahami istilah-istilah seperti APD, jarak sosial, dan pelacakan kontak.

Namun ketika kita mengira kita sudah menguasai sebagian besar terminologi tersebut, kita dihadapkan pada serangkaian kata baru: mutasi, varian, dan strain.

Jadi apa maksudnya?

Materi genetik SARS-CoV-2, virus corona penyebab COVID-19, disebut asam ribonukleat (RNA). Untuk mereplikasi dan menimbulkan infeksi, RNA SARS-CoV-2 harus membajak sel inang dan menggunakan mesin sel untuk menggandakan dirinya sendiri.

Kesalahan sering terjadi pada proses penggandaan RNA virus. Hal ini menghasilkan virus yang mirip tetapi bukan salinan persis dari virus aslinya. Kesalahan pada RNA virus ini disebut mutasiDan virus dengan mutasi ini telah dipanggil varian. Varian dapat berbeda dengan satu atau banyak mutasi.

Tidak semua mutasi mempunyai efek yang sama. Untuk lebih memahami hal ini, kita perlu memahami dasar-dasar kode genetik kita (DNA untuk manusia; RNA untuk SARS-CoV-2). Kode ini seperti cetak biru yang menjadi dasar semua organisme dibangun. Ketika mutasi terjadi pada satu titik, mutasi tersebut belum tentu mengubah salah satu unsur penyusunnya (disebut asam amino). Dalam hal ini, hal tersebut tidak akan mengubah cara organisme (manusia atau virus) terbentuk.

Namun terkadang, mutasi tunggal ini terjadi pada bagian RNA virus yang menyebabkan perubahan pada bahan penyusun tertentu. Dalam beberapa kasus, mungkin terdapat banyak mutasi yang bersama-sama mengubah unsur penyusunnya.

Varian disebut sebagai a tekanan ketika ia menunjukkan ciri-ciri fisik yang berbeda. Sederhananya, strain adalah varian yang terbentuk secara berbeda, sehingga berperilaku berbeda dibandingkan virus induknya. Perbedaan perilaku ini mungkin tidak kentara atau terlihat jelas.

Misalnya saja ini mungkin melibatkan perbedaan varian yang berikatan dengan reseptor sel berbeda, atau berikatan lebih kuat dengan suatu reseptor, atau bereplikasi lebih cepat, atau bertransmisi lebih efisien, dan seterusnya.

Pada dasarnya semua strain adalah varian, namun tidak semua varian merupakan strain.

Varian umum (yang juga merupakan strain)

Tiga dari varian SARS-CoV-2 yang paling umum adalah varian yang kita kenal sebagai varian Inggris (B117), varian Afrika Selatan (B1351), dan varian Brasil (P1). Masing-masing berisi beberapa mutasi berbeda.

Mari kita lihat varian Inggris sebagai contoh. Varian ini memiliki sejumlah besar mutasi pada protein kuku, yang membantu virus dalam upayanya menyerang sel manusia.

Meningkatnya penularan varian Inggris diduga terkait dengan mutasi yang disebut N501Y, yang memungkinkan SARS-CoV-2 agar lebih mudah berikatan dengan reseptor manusia ACE2, pintu masuk SARS-CoV-2 ke berbagai sel manusia.

Varian ini kini tersebar luas lebih dari 70 negaradan baru-baru ini dilacak di Australia.

Meskipun kita biasanya menyebutnya sebagai “varian Inggris”, virus ini juga merupakan strain karena menunjukkan perilaku yang berbeda dari strain induknya.

Kami masih harus banyak belajar

Ada beberapa kebingungan tentang cara terbaik menggunakan istilah-istilah ini. Karena semua strain adalah varian (tetapi tidak semua varian adalah strain), maka masuk akal jika istilah varian lebih umum. Namun ketika ilmu pengetahuan menunjukkan bahwa varian-varian ini berperilaku berbeda, akan lebih tepat untuk menyebutnya sebagai strain.

Itu menyenangkan, itu Organisasi Kesehatan Dunia dan departemen kesehatan di Australia tampaknya menggunakan istilah tersebut dengan benar dalam konteks SARS-CoV-2.

Pertanyaan besar yang ditanyakan semua orang saat ini adalah bagaimana varian dan strain baru akan memengaruhi efektivitas vaksin COVID-19.

Komunitas ilmiah terus-menerus mengungkap lebih banyak informasi tentang mutasi, varian, dan strain yang muncul, serta pengembang vaksin terkemuka menguji dan mengevaluasi efektivitas vaksin mereka dalam hal ini.

Beberapa vaksin yang baru dilisensikan tampaknya memberikan perlindungan yang baik terhadap varian Inggris, namun data terkini dari Novavax, Johnson & Johnson, dan Oxford/AstraZeneca menunjukkan kemungkinan berkurangnya perlindungan terhadap varian Afrika Selatan.

Otoritas kesehatan di Afrika Selatan baru-baru ini terputus penyebaran vaksin Oxford/AstraZeneca karena alasan ini. Namun, masih terlalu dini untuk mengatakan apa dampaknya, jika ada, terhadap rencana vaksin Australia.

Penyebaran vaksin di Australia akan menilai semua informasi yang terungkap dan memastikan tersedianya perlindungan optimal bagi masyarakat.

– Percakapan|Rappler.com

Lara Herrero adalah Pemimpin Peneliti di bidang Virologi dan Penyakit Menular, Universitas Griffith.

Eugene Madzokere adalah kandidat PhD di bidang Virologi, Universitas Griffith.

Bagian ini adalah awalnya diterbitkan di The Conversation di bawah lisensi Creative Commons.